Das Gemeindegebiet der Politischen Kirchberg erstreckt sich über mehrere Schulgemeinden und ist somit nicht deckungsgleich mit der Schulgemeinde Kirchberg.

Die Schulgemeinde Kirchberg umfasst die Schulkreise Kirchberg, Bazenheid, Dietschwil und Müselbach. Als Gesamtschulgemeinde werden an vier Schulorten der Kindergarten und die Primarschulen unterrichtet. Die Oberstufen (7. - 9. Schuljahr) werden in Bazenheid und für Kirchberg, Dietschwil und Müselbach in Kirchberg geführt.

Die Primarschulgemeinde Gähwil ist als eigenständige Körperschaft für den westlichen Gemeindeteil zuständig. Kindergarten und die Primarschulen der 1. bis 6. Klasse können die Schule in Gähwil besuchen. Für den Besuch der Oberstufe besteht mit der Schulgemeinde Kirchberg eine vertragliche Regelung. Die Schüler des 7. - 9. Schuljahres besuchen die Schule im Oberstufenschulhaus in Kirchberg.

Im Grenzgebiet zum Kanton Thurgau besteht für die Weiler und Höfe Stelz, Engi, Braunberg, Schönau, Ernstel und Buomberg ein Staatsvertrag für den Schulbesuch in den thurgauischen Schulgemeinden Rickenbach, Dussnang-Oberwangen, bzw. Fischingen. Die südwestlichste Liegenschaft Egghof gehört zur Schulgemeinde Mühlrüti.

Die Schulsekretariate in Kirchberg oder Gähwil sind die Anlaufstellen für alle Fragen im Bereich der Volksschule, vom Kindergarten über die Primarschule bis zur Oberstufe.